Amidáza (AMD)
Enzýmy:Sú makromolekulárne biologické katalyzátory, väčšina enzýmov sú proteíny
Amidáza:Katalyzujú hydrolýzu rôznych endogénnych a cudzích alifatických a aromatických amidov prenosom acylovej skupiny na vodu za vzniku voľných kyselín a amoniaku. Kyseliny hydroxámové a iné organické kyseliny sa široko používajú ako liečivá, pretože sú zložkami rastových faktorov, antibiotík a inhibítorov nádorov. Amidázy možno rozdeliť na acylázy typu R a typu S podľa stereoselektivity katalyzátora.
Okrem katalýzy hydrolýzy amidov môže amidáza katalyzovať aj reakcie prenosu acylu v prítomnosti kosubstrátov, ako je hydroxylamín.
Amidázy z rôznych zdrojov majú rôznu substrátovú špecifickosť, niektoré z nich dokážu hydrolyzovať iba aromatické amidy, niektoré iba alifatické amidy a niektoré hydrolyzujú α- alebo ω-aminoamidy. Väčšina amínov má dobrú katalytickú aktivitu iba pre acyklické alebo jednoduché aromatické amidy, ale pre komplexné aromatické zlúčeniny majú heterocyklické amidy, najmä amidy s orto substituentmi, vo všeobecnosti nízku aktivitu (len niekoľko enzýmov vykazuje lepšie katalytické účinky).
Katalytický mechanizmus:
| Enzýmy | Kód produktu | Kód produktu |
| Enzýmový prášok | ES-AMD-101~ ES-AMD-119 | sada 19 amidáz, každá po 50 mg, 19 položiek * 50 mg / položka alebo iné množstvo |
| Skríningová súprava (SynKit) | ES-AMD-1900 | sada 19 amidáz, každá po 1 mg 19 položiek * 1 mg / položka |
★ Vysoká substrátová špecifickosť.
★ Silná chirálna selektivita.
★ Vysoká účinnosť konverzie.
★ Menej vedľajších produktov.
★ Mierne reakčné podmienky.
★ Šetrné k životnému prostrediu.
➢ Skríning enzýmov by sa mal vykonávať pre špecifické substráty kvôli špecifickosti substrátu a mal by sa vybrať enzým, ktorý katalyzuje cieľový substrát s najlepším katalytickým účinkom.
➢ Nikdy neprichádza do kontaktu s extrémnymi podmienkami, ako sú: vysoká teplota, vysoké/nízke pH a organické rozpúšťadlá s vysokou koncentráciou.
➢ Reakčný systém by mal normálne obsahovať substrát, tlmivý roztok (optimálne pH reakcie enzýmu). V reakčnom systéme prenosu acylu by mali byť prítomné kosubstráty, ako napríklad hydroxylamín.
➢ AMD by sa mal pridať do reakčného systému ako posledný s optimálnym pH a teplotou reakcie.
➢ Všetky druhy AMD majú rôzne optimálne reakčné podmienky, preto by sa každý z nich mal ďalej študovať samostatne.
Príklad 1(1):
Hydrolytická aktivita na rôzne amidové substráty
| Substrát | Špecifická aktivita μmol min-1mg-1 | Substrát | Špecifická aktivita μmol min-1mg-1 |
| Acetamid | 3,8 | ο-OH benzamid | 1,4 |
| Propionamid | 3,9 | p-OH benzamid | 1.2 |
| Laktamid | 12,8 | ο-NH2benzamid | 1,0 |
| Butyramid | 11,9 | p-NH2benzamid | 0,8 |
| Izobutyramid | 26.2 | ο-Toluamid | 0,3 |
| Pentánamid | 22,0 | p-Toluamid | 8.1 |
| Hexánamid | 6.4 | Nikotínamid | 1,7 |
| Cyklohexánamid | 19,5 | Izonikotinamid | 1,8 |
| Akrylamid | 10.2 | Pikolinamid | 2.1 |
| Metakrylamid | 3,5 | 3-Fenylpropionamid | 7,6 |
| Prolínamid | 3.4 | Indol-3-acetamid | 1,9 |
| Benzamid | 6,8 |
Reakcia sa uskutočnila v 50 mM roztoku fosforečnanu sodného pufru, pH 7,5, pri teplote 70 °C.
| Amidy | Hydroxylamín | Hydrazín |
| Acetamid | 8.4 | 1,4 |
| Propionamid | 18,4 | 3.0 |
| Izobutyramid | 25,0 | 22,7 |
| Benzamid | 9.2 | 6.1 |
Reakcia sa uskutočnila v 50 mM roztoku fosforečnanu sodného pufru, pH 7,5, pri teplote 70 °C.
Súvisiaca koncentrácia činidla: amidy, 100 mM (benzamid, 10 mM); hydroxylamín a hydrazín, 400 mM; enzým 0,9 μM.
Príklad 2(2):
Príklad 3(3):
1. D'Abusco AS, Ammendola S., a kol. Extremophiles, 2001, 5:183-192.
2. Guo FM, Wu JP, Yang LR a kol. Procesná biochémia, 2015, 50(8): 1400-1404.
3. Zheng RC, Jin JQ, Wu ZM a kol. Bioorganická chémia, 2017, dostupné online 7.
